В состав Академии входят Автономная некоммерческая организация научный центр — АНО НЦ «РАОиФН — Академический исследовательский институт им. ак. М.В.Ломоносова» — Юридическое лицо :
1). Центр «Китайский научный центр Российской академии общественных и фундаментальных наук имени ак. М.В. Ломоносова» (г. Шанхай, КНР) — Обособленное структурное подразделение Академии;
2). Автономная некоммерческая организация научный центр «Академия общественных и фундаментальных наук имени академика М.В. Ломоносова — АКАДЕМИЧЕСКИЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ» (АНО НЦ «Академия М.В. Ломоносова»);
3). Отделение-Факультет «Международных отношений, Экономики и Права» (Политические, социологические, политические, юридические, медицинские, экономические науки )
4). Отделение «Сословные и национальные традиции» (Исторические, политические, педагогические, психологические науки, в т.ч., и социальная психология, социологические, философские, экономические и юридические науки);
5). Отделение «Клинической и экспериментальной медицины» (Медицинские науки), Отделение «Инженерно-технических наук»(Военные, технические науки);
6). Кафедра инновационных лекарственных препаратов, функциональных экстрактов и напитков (Медицинские, Фармацевтические, Биологические науки, Нанотехнологии в медицине, фармацевтике и биотехнологии);
7). Отделение «Анализа инновационных технологий, систем и процессов» (Технические, экономические науки);
8). Отделение «Социальной структуры, социальных институтов и процессов» (Социологические, философские, исторические, экономические, педагогические, политические и психологические науки);
9). Академический научно-педагогический институт РАОиФН им. ак. М.В. Ломоносова;
10). Отделение «Науки и техники высшей школы» (Военные, педагогические, психологические, технические, экономические науки);
11). Кафедра «Уголовного права и криминологии», Сектор «Уголовно-исполнительного и процессуального права» (Психологические и Юридические науки);
12). Кафедра Социологии и социальной сферы (Социологические, философские науки)
13). Отделение по подготовке научно-педагогических кадров — АНО НЦ «Академии М.В. Ломоносова — АИИ»;
14). Отделение «Фундаментальной медицины» (Биологические, медицинские, фармацевтические науки);
15). Отделение «наук о Земле» (Геолого-минералогические науки);
16). Отделение «Географические науки»;
17). Отделение «Истории и теории искусства»;
18). Филиал в городе-курорте Геленджике РАОиФН им. ак. М.В. Ломоносова;
19). Кафедра «Иностранных языков и политологии, политических процессов и технологий».
